El perfil investigador del Departamento de Economía Aplicada guarda una estrecha relación con la identidad de las unidades que lo forman.
- Los campos centrales de la Unidad de Estadística y Econometría son los vinculados a la Modelización y predicción económica y al análisis de la Desigualdad, la pobreza y el bienestar social.
- La investigación de la Unidad de Estructura Económica se centra en las cuestiones correspondientes a la Economía internacional, la Economía regional, la Economía de los recursos naturales y del medio ambiente y el Análisis económico de los sectores, tanto institucionales como productivos.